近年来,我国肉鸡自主育种不断取得突破,但因起步晚、种质资源积累不足等原因,与欧美发达国家相比仍较为落后。分子育种技术的发展有望加速肉鸡育种进程,但其依赖的家鸡全基因组图谱目前仍不完善。
近日,徐洛浩教授课题组在《美国科学院院刊》(PNAS)发表题为Evolutionary analysis of a lete chicken genome(家鸡基因组完成图的演化分析)的研究论文,以中国特有家鸡品系胡须鸡为材料,在国际上率先完成一个家鸡的全基因组完成图谱。这是继去年人类基因组完成图公布以来,首个发表的脊椎动物基因组完成图,是基因组完成图谱绘制技术首次在经济动物中的应用。家鸡基因组完成图的绘制,是精准分子设计育种的重要基础,是国内外同行紧密攻克的难题之一,对肉鸡遗传育种工作的推进、实现肉鸡种业弯道超车具有重要意义。
该项目历时两年半,团队成员采集到惠阳胡须鸡家系样品,利用长读长测序技术,完成一只母鸡的全基因组图谱绘制,鉴定了原先基因组组装中所缺失的6条染色体。基于此,研究人员绘制了脊索动物染色体演化全景图,重构了45条脊椎动物祖先染色体。同时,阐明了家鸡着丝粒的起源、序列构造及多样性。此外,课题组精细刻画了W性染色体的表观遗传学特征。该成果为理解脊椎动物基因组演化和染色体生物学提供了新的认识,为家鸡遗传育种提供了重要基础,具有重大科学意义。
据悉,该论文第一署名单位为种质创制大科学中心和淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室(西南大学)。西南大学徐洛浩教授、扬州大学常国斌教授为通讯作者,福建师范大学黄镇副教授、西南大学徐枣旭博士、扬州大学白皓副研究员为共同第一作者。硕士生康纳以及联合培养博士生罗浩然参与该研究。